El 5 de
Mayo de 2008 falleció en Madrid, a la edad de 41 años, el Dr. Ángel Ramírez
Ortiz, Director de la Unidad
de Bioinformática del Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa"
(CSIC-UAM), uno de los más destacados exponentes de la comunidad de la
bioinformática estructural.
Para
recordar su memoria, se está organizando el congreso internacional:
"International Workshop in Memoriam of Ángel Ramírez Ortiz: Structural
Bioinformatics and Beyond. - Associated to the IX Jornadas de Bioinformática",
que tendrá lugar en Madrid del 26 al 28 de enero de 2009.
Ángel Ramírez ha dejado importantes aportaciones en este campo en áreas tan relevantes como
el análisis y la evolución de la estructura de proteínas, el modelado
tridimensional de macromoléculas biológicas, el diseño racional de fármacos y
el estudio cuantitativo de las relaciones existentes entre la estructura
química de moléculas pequeñas y su actividad biológica. Sus contribuciones más conocidas han sido
probablemente aquellas relacionadas con el desarrollo de importantes algoritmos,
en particular: a) CDOCK y COMBINE para caracterizar las interacciones entre
proteínas diana y moléculas pequeñas (docking), con el fin de cribar
computacionalmente enormes bases de datos de potenciales fármacos (virtual
screening); b) el algoritmo MAMMOTH para comparar estructuras de proteínas,
siendo uno de los más usados para alineamientos de estructuras, sobre todo
alineamientos múltiples; y c) el algoritmo MONSSTER, en colaboración con J.
Skolnick y A. Kolinsky, para modelar
estructuras de proteínas desconocidas. 
No obstante, sus aportaciones van mucho más allá del simple desarrollo de programas. Ángel supo derivar un valioso conocimiento biológico de estos métodos para investigar, entre otros temas, al estudio de la evolución estructural de proteínas, los mecanismos moleculares de funcionamiento de las proteínas y el diseño de fármacos (irónicamente, muchos de ellos precisamente contra el cáncer), que han sido testados con éxito en distintos laboratorios.
Se
pretende que este congreso no sea sólo una ocasión para recordar a Ángel y sus
importantes contribuciones, sino que se transforme en un momento de encuentro
de la comunidad de bioinformática estructural a nivel internacional, y que
favorezca el debate sobre la situación actual en las áreas a las que Ángel ha
dedicado su trabajo de investigación. Se pretende también estimular el diálogo
con los investigadores experimentales en biología estructural porque, como nos
enseñó Ángel, la interacción entre biólogos computacionales y experimentales es
fundamental para avanzar en el entendimiento de sistemas tan complejos como los
sistemas biológicos.
Se
aspira a atraer a los mejores investigadores de estos campos a nivel
internacional, así entre
los keynote speakers es necesario destacar a dos de los investigadores de
bioinformática estructural más destacados a nivel mundial: Jeffrey
Skolnick, Director del Center for the Study of Systems Biology, Georgia Technical University, y David Jones, de la University College London. El
congreso contará asimismo con la presencia de nombres de prestigio como Nikolay
Dokholyan, Ruben Abagyan, Christine Orengo, Rebecca Wade, Luis Serrano, Balbino Alarcón, Alfonso Tarancón y Federico Gago entre otros. Entre las instituciones participantes podemos destacar a la Comunidad de Madrid, el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO), el programa de Actividades I+D BIPEDD de la Comunidad de Madrid, la Universidad Complutense de Madrid, el Instituto Nacional de Bioinformática (INB), la Red Nacional de Bioinformática, la Fundación Genoma España, la Red Gallega de Bioinformática, el Instituto BIFI (Universidad de Zaragoza) y algunas empresas como Silicon Graphics, Lilly o PharmaMar y Noscira (Grupo Zeltia).