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viernes, 08 de junio de 2007

Pues sí, los manuscritos en el nuevo formato de fichero de Microsoft Word 2007, Open Office XML, están siendo sistemáticamente rechazados por las revistas científicas más prestigiosas: Nature, Science, todas las publicaciones científicas de Wiley, etc... La razón detrás de esta decisión no es política, sino técnica. Estas revistas están encontrando muchos problemas para integrar el nuevo formato de documento de Microsoft en sus protocolos y sistemas de publicación, debido en gran medida a que las ecuaciones son renderizadas en este formato como un gráfico más (a diferencia de las versiones anteriores). Para más INRI, los datos asociados del editor de ecuaciones de Word 2007 no son compatibles con el estándar MathML, lo cuál impide cualquier posibilidad de procesamiento de las mismas mediante los pipelines de publicación electrónica de estas revistas. Desgraciadamente, aunque desde Word 2007 grabes en otro de los formatos de Word, se sigue preservando la información del editor de ecuaciones de la misma manera incompatible.


Esta noticia ha causado una gran controversia, como podreis observar en Undernews en una entrada del 31 de Mayo. Investigadores de otras áreas científicas (por ejemplo, ciencias de la computación) no tienen este problema al haber elegido las revistas de referencia de su sector como formato válido de los manuscritos LaTeX o PDF. Algunos sectores a favor del formato estándar OpenDocument (usado por las últimas versiones de IBM Lotus, StarOffice, KOffice, AbiWord y OpenOffice), y en general, de los formatos abiertos abogan por abandonar el formato Word y otros formatos propietarios para la publicación científica. Sin embargo, muchas herramientas como EndNote, indispensables para muchos científicos a la hora de escribir artículos, sólo se integran adecuadamente con el estándar de facto de los procesadores de texto, Microsoft Word.

La polémica está servida...

20:08 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (3)

Hoy me ha llegado la siguiente información sobre los cursos del Gulbenkian Training Programme in Bioinformatics:

El programa de cursos GTPB en Portugal accepta con placer inscripciones en
cualquiera de sus cursos de entrenamiento. Además, se facilita la búsqueda de
hotel o residencia académica, cuando sea solicitada.

Consultar con periodicidad el sitio web: http://gtpb.igc.gulbenkian.pt

Hace unos años tuve el placer de impartir clases en Oeiras, y es una ciudad costera magnífica, bien comunicada con Lisboa por tren. Los cursos se celebran en el Instituto Gulbenkian de Ciência, que forma parte de la Fundação Calouste Gulbenkian, con ponentes de gran nivel. Así que si estais buscando algún curso internacional interesante de corta duración, os recomiendo que consulteis de vez en cuando la web referenciada arriba.

19:17 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (0)

De nuevo David González (¡gracias David!) me ha mandado un enlace interesante sobre bioinformática. Se trata de Bioinformatics Zen, un blog de bioinformática en inglés. La última entrada publicada en ese blog trata sobre la edición especial de bio::blogs (que es un blog carnival), que cita entradas de los mejores blogs de bioinformática existentes, y que es publicada en nodalpoint.org. Se nota que los autores de bio::blogs se curran bastante sus recopilatorios, porque para cada edición generan un PDF descargable para cada uno de ellos. Todo el contenido de los recopilatorios ha sido obtenido de blogs científicos, con lo que son una buena fuente de divulgación cientifíca sobre los últimos avances en bioinformática.

Enlaces
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19:02 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (0)