LoginRSS 2.0 Feed

martes, 06 de marzo de 2007

Hoy escribió Begoña preguntando algo muy sencillo, pero a la vez muy complicado: la existencia y localización de algún informe relativo a las aplicaciones y relevancia de las TIC en la Biotecnología. Personalmente no me dedico a leer tales informes, pero buscando un poco encontré en madri+d una presentación algo antigua (del año 2003) enfocada en el uso de Computación en Grid en ciencia.


http://www.madrimasd.org/queesmadrimasd/En_Prensa/
PrensaRediMadrid/documentos/

Relevancia_y_Aplicaciones_de_las_TIC_en_Biomedicina
_y_Biotecnologia.pdf

También encontré un documento más reciente (de finales del 2005), que habla sobre el papel de los parques científicos y tecnológicos en las estrategias de I+D+i, y que aunque no sea específico de la bioinformática, puede ayudar:

http://www.madrimasd.org/revista/revista33/tribuna/tribuna1.asp

En bioinformática usamos casi todas las tecnologías que estén a nuestro alcance:

  • Redes de alta velocidad para la transferencia de las enormes bases de datos (de cientos de GB) que usamos.

  • Sistemas de supercomputación (granjas de computación, supercomputación, computación en grid) para la resolución de diversos problemas, como predicción de genes, plegamiento de proteínas mediante dinámica molecular, etc...

  • Bases de datos relacionales y bases de datos XML, para aplicar técnicas de minería de datos e integración de información.

  • Tecnologías web (AJAX, web services, web semántica, etc...) que nos ayudan tanto en el acceso a servicios remotos, como en la representación de la información para el usuario final.

  • Uso de la tecnología FPGA para ejecutar de forma masivamente paralela los algoritmos más asentados en la bioinformática.

  • Técnicas de redes neuronales, inteligencia artifical e inferencia lógica.

y un larguísimo etcétera que me dejo en el tintero. Seguro que el informe y gente más documentada que yo puede darte una visión más precisa del uso actual de las tecnologías de la información en este campo.

¿Alguien puede aportar documentación adicional?

20:49 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (1)

Hace una semana mandó Chevi una disertación bastante extensa acerca de si existe la Bioinformática, tras haber asistido a la escuela invernal de Bioinformática celebrada en Bolonia. Advierto que esta disertación puede que levante ampollas, pero quizás por eso es muy interesante: es (¡por fin!) una opinión discordante de lo publicado habitualmente en este weblog, y que llega a una conclusión muy cierta. Aquí está el texto completo de la disertación:

 

¿Existe la Bioinformática? Esa misma pregunta me hice yo la semana pasada, semana en la que asistí a la escuela invernal de Bioinformática celebrada en Bolonia. Y al finalizar dicho curso, tuve la respuesta clara y nítida...NO. Por un lado, tenemos un montón de biólogos y químicos que necesitan de las nuevas tecnologías de la información para poder trabajar y que utilizan esas herramientas sin saber si son o no las más adecuadas. Y por otro lado, un puñado de informáticos que lo único que buscan son montañas de datos (sin importar mucho que significan) para poder aplicar sus herramientas de extracción de conocimiento. Ambos grupos discurren de manera separada e independiente, siendo el primero de ellos el mayoritario y controla la mayoría de cursos y congresos.
Mi opinión es la siguiente: la bioinformática tendría que ser un matrimonio bien avenido entre esos dos grupos. Los informáticos proporcionarían las mejores herramientas y los biólogos proporcionarían sus conocimientos para dar significado a los datos y resultados de los informáticos....y esto señores, por ahora existe en MUY pocas ocasiones.
¿Que opinan?

Personalmente pienso que parte de su opinión es cierta, en el sentido de que no todo el mundo que trabaja con herramientas bioinformáticas sabe interpretar lo que está obteniendo (ya venga del mundo biológico, informático u otro). También es cierto que no existe esa dicotomía tan exagerada que describe Chevi entre los que buscan en las montañas de datos y los que usan las herramientas, porque en el grupo donde trabajo la mayor parte son biólogos o bioquímicos, y trabajan con esas montañas de datos sabiendo muy bien qué tienen entre manos.

Pues como escribió Chevi, ¿qué opinais?

20:06 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (7)