Algunos de vosotros habrá escuchado hablar de competiciones como CASP (Comprehensive Assessment of Structure Prediction), que sirven para comprobar el estado del arte de los métodos de predicción de las distintas características de las estructuras de proteínas (y que este año llega a su séptima edición). Pues bien, si quereis asistir a una reunión donde hay charlas que traten estos temas, pero sin tener que viajar al otro lado del charco, los próximos 3,4 y 5 de Julio se va a celebrar en Barcelona "Current challenges in computational structural biology: improving model refinement for functional predictions". A continuación viene el anuncio oficial que me llegó por e-mail:

Meeting announcement. Last call for participants.

Current challenges in computational structura biology:
improving model refinement for functional predictions

Barcelona, 3-5 July 2006


Please, check the program at the meeting's web page:

http://mmb.pcb.ub.es/MODREF2006

Thanks to its ability to generate usable models, computational chemistry
has branched into many different biological applications. Nevertheless,
the uncertainty associated with all molecular models is high. New
refinement methods are clearly needed to upgrade these models to
reliable predictions, which could be used with confidence both by
experimentalist and further computational studies. The goal of the
workshop is to share new views about computational refinement and
theoretical approaches that will enable us to improve current
low-resolution models and make better use of experimental structures.

We will have great pleasure in welcoming you to Barcelona for the MODREF
2006 Workshop and we trust that you will enjoy it.

The Organizing Committee

Confirmed speakers

Opening lecture
David T. Jones (University College London, UK)

Current challenges in model refinement
Alfonso Valencia CNIO, Madrid
Ruben Abagyan The Scripps Research Institute, CA. USA
Nick Furnham Univ. of Cambridge, UK
Roland Dunbrack Fox Chase Cancer Center, PA. USA
Xavier Salvatella Univ. of Cambridge, UK

Improving structural models for systems of pharmacological interest
Angel Ortiz CBM-CSIC, Madrid
Max Totrov Molsoft, CA. USA
Nils Weskamp Philipps-Universität Marburg. Germany

Experimental and theoretical models in the structural proteomics era
Jeremy Smith Univ. Heidelberg, Germany
Javier Sancho Univ. Zaragoza
Miquel Pons Univ. Barcelona, IRB-PCB
JM Sanchez Ruiz Univ. Granada
Patrick Aloy IRB-PCB. ICREA. Barcelona
Xavier Gomis-Rüth IBMB - CSIC. Barcelona
Pau Bernado Univ. Barcelona- PCB

New trends in model refinement
Modesto Orozco Univ. Barcelona, IRB-PCB, BSC
Anna Tramontano Univ. La Sapienza. Roma Italy

Hoy me ha llegado a través de la lista de la red de bioinformática el anuncio del curso de verano "Aproximación a algunos temas avanzados de la Bioinformática de hoy: Gripe aviar (H5N1), Microarrays y SNPs", que está organizado por miembros de la Facultad de Matemáticas de la Universidad de Santiago. El curso se celebrará del 10 al 14 de Julio, y para l@s que querais asistir, teneis de plazo hasta el 30 de Junio para inscribiros. Os incluyo el mensaje original:

Anuncio de curso de verano "Aproximación a algunos temas avanzados de la
Bioinfomática de hoy: Gripe aviar (H5N1), Microarrays, y SNPs".

En la Universidad de Santiago de Compostela, tendrá lugar un Curso de
Verano (30 horas) de Bioinformática. Será del 10 al 14 de Julio y el
plazo de preinscripción y matrícula es hasta el 30 de Junio.

Os animo a que visitéis la página web del curso 
http://madma.usc.es/cursoverano/

Un saludo,
Manuel Calaza (Secretario del curso).

Esta mañana ha mandado Ana Rojas a la lista del grupo donde trabajo el enlace a un paquete de R (el proyecto open-source de realización de un software de análisis estadístico compatible con S-plus) que sirve para simular y analizar topologías de árboles filogenéticos. El paquete se llama apTreeshape, y usa índices estadísticos para la simulación y análisis de las distintas topologías.

Según la página del paquete, este paquete es una librería 'compañera' del paquete ape, un paquete de R enfocado en análisis filogenéticos y evolutivos, y que proporciona funciones para leer, escribir, dibujar y manipular árboles filogenéticos (entre otras muchas funcionalidades).

Espero que os sirva este paquete de análisis.

Enlaces relacionados:

• Paquete apTreeshape de R.
• Paquete ape de R.
• CRAN (The Comprehensive R Archive Network)
• Página principal de R.