Enviado el martes, 06 de junio de 2006 7:29
Últimamente no le estoy dedicando el tiempo que tendría que dedicarle al weblog con la adaptación y puesta en marcha del entorno de trabajo en el CNIO. "Fruto" de ello ha sido que se me traspapelase el siguiente mensaje que envió
Conny desde Nicaragua, solicitando orientación:
Estimados compañeros, soy estudiante de maestría
en Ciencias de Computación y estoy estudiando
mucho la bioinformática porque quiero hacer mi
tesis basada en ésta. Solicito su ayuda a ver si
me pueden enviar información acerca de
herramientas de minería de datos que se aplican
en bioinformática y los algoritmos más usados ya
sea en genomica, proteómica, análisis de datos de
especies etc, es decir las áreas más claves donde
se aplica la bioinformática actualmente. A
propósito, soy nicaragüense y tengo 23 años,
estudio en Costa Rica. Mi sueño es etudiar mi
doctorado en bioinformática en España ya que es
uno de los países numero uno en este emergente
campo. Espero sus respuestas.
Aquí está mi propio granito de arena, Conny, con enlaces a los principales algoritmos. Lo más importante: la herramienta básica para buscar artículos es PubMed, la base de datos de abstracts de artículos científicos. El enlace a PubMed es:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi He estado buscando los artículos de los algoritmos Smith&Waterman, Blast, PSI-Blast y otros, y aquí están los enlaces. El primero de los artículos sólo está disponible bajo suscripción, con lo que de momento tendrás que contentarte con el abstract. En cuanto al resto, espero que no tengas problemas con los enlaces.
(Enlace al abstract de Smith & Waterman)
http://www.springerlink.com/(fmavvh45ujq1fsvukkpkep45)/app/home/contribution.asp?referrer=parent&backto=issue,7,10;journal,126,192;linkingpublicationresults,1:400107,1(Enlaces al artículo de Blast y PSI-Blast, en HTML y en PDF)
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/25/17/3389http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/25/17/3389.pdf(Enlace al artículo de ClustalW, en PDF)
http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?tool=EBI&pubmedid=7984417&action=stream&blobtype=pdf(Enlace al artículo de HMMer)
http://selab.wustl.edu/publications/Eddy98/Eddy98-reprint.pdf(Enlace al artículo de T-Coffee)
http://igs-server.cnrs-mrs.fr/~cnotred/Publications/Pdf/tcoffee.pdf