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martes, 06 de junio de 2006

Un incunable de los videos educativos

"Síntesis de proteínas. Una épica a nivel celular". Así se titula un auténtico incunable de los videos educativos que encontró uno de mis compañeros de trabajo hace cosa de un mes. En él se explica paso a paso, a lo largo de 13 minutos y medio, el funcionamiento de la maquinaria celular durante el proceso de síntesis de proteínas.

Lo más atractivo y original de este video es que ¡es una simulación hecha con personas a ritmo musical! Se pueden ver alrededor de 50 voluntarios moviéndose a lo largo de un cesped, moviéndose de forma coordinada para simular el funcionamiento de la maquinaria celular mientras se sintetiza una proteína.
Este tipo de videos educativos se agradecen sobre manera, en esta era en la que un buen porcentaje de los escenarios y personajes de las películas o son generados por ordenador, o son retocados en postproducción. Seguramente nadie que lo vea se quedará indiferente, pero lo que tengo claro es que los actores y actrices del video seguro que ahora saben cómo funciona esta faceta de la maquinaria celular.

Enlace: http://biology.kenyon.edu/slonc/Micro/protein_synth102105.mp4

16:32 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (16)

Solicitud de una futura bioinformática desde Nigaragua

Últimamente no le estoy dedicando el tiempo que tendría que dedicarle al weblog con la adaptación y puesta en marcha del entorno de trabajo en el CNIO. "Fruto" de ello ha sido que se me traspapelase el siguiente mensaje que envió Conny desde Nicaragua, solicitando orientación:

Estimados compañeros, soy estudiante de maestría
en Ciencias de Computación y estoy estudiando
mucho la bioinformática porque quiero hacer mi
tesis basada en ésta. Solicito su ayuda a ver si
me pueden enviar información acerca de
herramientas de minería de datos que se aplican
en bioinformática y los algoritmos más usados ya
sea en genomica, proteómica, análisis de datos de
especies etc, es decir las áreas más claves donde
se aplica la bioinformática actualmente. A
propósito, soy nicaragüense y tengo 23 años,
estudio en Costa Rica. Mi sueño es etudiar mi
doctorado en bioinformática en España ya que es
uno de los países numero uno en este emergente
campo. Espero sus respuestas.

    Aquí está mi propio granito de arena, Conny, con enlaces a los principales algoritmos. Lo más importante: la herramienta básica para buscar artículos es PubMed, la base de datos de abstracts de artículos científicos. El enlace a PubMed es:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

    He estado buscando los artículos de los algoritmos Smith&Waterman, Blast, PSI-Blast y otros, y aquí están los enlaces. El primero de los artículos sólo está disponible bajo suscripción, con lo que de momento tendrás que contentarte con el abstract. En cuanto al resto, espero que no tengas problemas con los enlaces.

(Enlace al abstract de Smith & Waterman)
http://www.springerlink.com/(fmavvh45ujq1fsvukkpkep45)/app/home/contribution.asp?referrer=parent&backto=issue,7,10;journal,126,192;linkingpublicationresults,1:400107,1

(Enlaces al artículo de Blast y PSI-Blast, en HTML y en PDF)
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/25/17/3389
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/25/17/3389.pdf

(Enlace al artículo de ClustalW, en PDF)
http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?tool=EBI&pubmedid=7984417&action=stream&blobtype=pdf

(Enlace al artículo de HMMer)
http://selab.wustl.edu/publications/Eddy98/Eddy98-reprint.pdf

(Enlace al artículo de T-Coffee)
http://igs-server.cnrs-mrs.fr/~cnotred/Publications/Pdf/tcoffee.pdf

7:29 | gestionado por José María Fernández González | Enviar comentario (4)