Enviado el sábado, 11 de febrero de 2006 3:04
Acabo de descubrir que los responsables de
PDB van a empezar a proporcionar anualmente copias congeladas en el tiempo de su base de datos. El sitio FTP donde se almacenan esas copias es:
ftp://snapshots.rcsb.org/. Actualmente están disponibles dos copias, correspondientes al 6 de Enero de 2005 y 3 de Enero de 2006, y sirven como referencia estable a tod@s aquell@s que trabajeis con estructuras de proteínas. Por ejemplo, a partir de ahora será más fácil saber cuándo un nuevo programa de predicción de estructura tridimensional basado en threading es mejor que uno más antiguo, debido a la existencia de un conjunto de referencia estable, o si una red neuronal de reconocimento de sitios de unión sesga demasiado sus resultados para estructuras no existentes cuando fue entrenada.
Los responsables de
UniProt también mantienen copias históricas, aunque con una frecuencia mayor que PDB. El sitio FTP es
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/uniprot/previous_major_releases/.
En definitiva, una buena iniciativa.